苋菜试管苗amaNACA 2-like基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘生财 匡华琴 谢礼洋 赖钟雄
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苋菜 试管苗 amaNACA-2 like 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 83-89
• 页数: 7页
• 分类号: S572
• 字数: 3630字
• 语种: 中文

摘要

以苋菜试管苗为材料,采用RT-PCR结合RACE技术进行amaNACA-2 like基因全长cDNA序列克隆,对其进行生物信息学分析.结果表明,苋菜amaNACA-2 like基因cDNA全长为896 bp,其中5'UTR 66 bp,3'UTR216 bp,polyA尾长17 bp,并包含一个615 bp开放阅读框,编码205个氨基酸.GenBank登录号为KC588966.生物信息学分析表明,该蛋白是一种亲水性细胞质蛋白,包括10个磷酸化位点和8个功能位点;该蛋白属于NAC蛋白超级家族(NAC superfamily),包含NAC功能位点,同时包括一段UBA超家族结构域;其二级结构由α螺旋、无规则卷曲结构、延伸链和β转折组成;系统进化树分析表明苋菜amaNACA 2-like蛋白独立形成一个分支,但与其他物种间亲缘关系较近,说明NACA 2-like蛋白在生物进化过程中比较保守.研究amaNACA-2 like基因克隆和生物信息学分析,可为深入研究其功能奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赖钟雄	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	473	4127	31.0	41.0
2	刘生财	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	52	150	7.0	8.0
3	谢礼洋	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	7	11	2.0	2.0
4	匡华琴	福建农林大学园艺植物生物工程研究所	6	7	2.0	2.0