膜性肾病差异性表达microRNA的靶基因功能分析

• 作者: 戴勇 陈文标 黄建溶
• 来源期刊: 暨南大学学报（自然科学与医学版）
• 学科: 医学
• 关键词: 膜性肾病 小核糖核酸 靶基因 GO富集 KEGG通路
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 所属期刊栏目: 医学
• 页码范围: 381-390
• 页数: 10页
• 分类号: R394-33
• 字数: 4400字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11778/j.jdxb.2014.04.009

摘要

目的：探讨膜性肾病（MN）差异性表达microRNA的靶基因主要参与的Gene Ontology（GO）富集与Kyo-to Encyclopedia Genes And Genomes（KEGG）通路．方法：100例MN患者与100例健康对照者（NC）作为实验对象．100例NC随机分成10组（NC1～10），每组10人．同样100例MN随机分成10组，每组10人（MN1～10）．分别从实验参与者静脉采取全血10 mL，来源于静脉血的单个核细胞用于提取RNA．总RNA以组为单位等量混合用于高通量技术测序（high-throughput sequencing），对RNA测序结果进行长度分布，基因比对，RNA分类注释，RNA特有序列及其公共序列分析后，获得小核糖核酸（microRNA）进行MN与NC差异性表达分析来寻找显著表达microRNA．应用相关的软件对差异性表达的microRNA进行靶基因预测，靶基因借助功能注释软件对其参与的生物过程进行GO富集及KE GG通路分析．结果：靶基因在GO富集分析中主要集中在细胞器官组成，细胞膜组成，离子结合，生物代谢过程，生物调节过程等．靶基因在KE GG通路分析中主要参与嘌呤代谢通路，代谢产物生物合成，癌症通路，蛋白激酶信号通路等．结论：MN与NC之间存在着显著差异性表达microRNA．差异性表达的microRNA的靶基因参与的GO富集与KE GG通路可能与MN的发病机制与临床症状有着密切的联系．