冰草EST-SSR引物和小麦EST-SSR引物在黑麦属基因组的通用性分析

• 作者: 代明 张锦鹏 李秀全 李飞 杨欣明 杨燕萍 段清清 车永和 鲁玉清
• 来源期刊: 麦类作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 冰草EST-SSR 小麦EST-SSR 黑麦属 有效扩增 通用性
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 735-739
• 页数: 5页
• 分类号: S512.5|S330
• 字数: 3644字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1009-1041.2014.06.02

摘要

为研究黑麦属植物的遗传多样性,开发R基因组特有的分子标记并绘制其遗传连锁图谱,选用1 343对冰草EST-SSR引物和786对小麦EST-SSR引物对新疆杂草黑麦和栽培黑麦(共计6份材料)的全基因组进行了PCR扩增,结果显示,有679对冰草EST-SSR引物能够扩出清晰的条带,占引物总数的50.6％;其中有187对引物在6份黑麦材料基因组中扩增产物表现为多态性,占其引物总数的13.9％,平均每对引物扩增条带数为1.1.有364对小麦EST-SSR引物可扩增出清晰的条带,占其引物总数的46.3％;其中有135对引物在6份黑麦材料基因组中扩增产物具有多态性,占其引物总数的17.1％,平均每对引物扩增条带数为2.0.冰草EST-SSR引物在黑麦中的有效扩增效率高于小麦EST-SSR的有效扩增效率,但扩增多态性后者大于前者.两种来源引物扩增强带比率分别为51.8％和32.6％.结果表明小麦和冰草的EST-SSR引物均可用于黑麦基因组分析研究.