中国板栗EST-SSR信息分析及其通用性

• 作者: 向闱 宁祖林 康明 黄宏文
• 来源期刊: 热带亚热带植物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 中国板栗 EST-SSR 栗属 通用性
• 年，卷（期）: 2010,（6）
• 页码范围: 665-669
• 分类号: Q347
• 字数: 4372字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-3395.2010.06.012

摘要

从已公布的壳斗科(Fagaceae)基因组数据库中获得48501条中国板栗(Castanea mollissima)EST序列,其中8479条EST含有12116个长度大于10 bp的SSR,EST-SSR的出现频率为24.98%.二核苷酸重复和三核苷酸重复是中国板栗EST-SSR最主要的重复类型,分别占总数的38.05%和42.20%.对中国板栗EST-SSR标记在茅栗(C.seguinii)和锥栗(C.henryi)的通用性检测表明,677对中国板栗EST-SSR引物皆能扩增,证实这些引物在栗属中国特有种间具有很高的通用性.115个位点的多态性分析表明,中国板栗、茅栗和锥栗分别有106、108和101个位点表现出多态性.在575个等位基因中,有260个(45.22%)是3物种的共有等位基因,各物种都有各自特有的等位基因.这项研究为中国栗属植物EST-SSR标记的建立及应用奠定了基础.