6株T4类噬菌体尾丝蛋白gp37基因密码子特性比较

• 作者: 任慧英 刘文华 张灿 温建新 逯凯 邹玲 韩姗姗
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 噬菌体 gp37基因 密码子偏好性 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（8）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 1330-1335
• 页数: 6页
• 分类号: Q754
• 字数: 4434字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2014.08.018

摘要

利用多种生物信息学软件对本实验室分离的1株T4类多价烈性噬菌体Bp7尾丝蛋白gp37基因与其他5株T4类噬菌体gp37基因进行密码子特征的分析比较.结果显示:Bp7与其他5株T4类噬菌体gp37基因密码子使用模式基本一致;Bp7尾丝蛋白gp37基因密码子偏好性较低,且偏爱使用以A或U为结尾的密码子;除AUG(Met)和UGG(Trp)外,确定了17种高频密码子;6株菌体gp37之间密码子偏好性比较发现,Bp7与JS98密码子使用最相近,与T4和T4T相对较远;gp37基因密码子的使用模式可能受中性突变和选择压力的共同作用.gp37基因密码子的分析结果将为Bp7尾丝蛋白的基因改造,以进一步拓宽其裂解谱及提高表达水平提供理论指导.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	温建新	青岛农业大学动物科技学院	88	360	10.0	14.0
2	邹玲	青岛农业大学动物科技学院	80	284	9.0	13.0
3	刘文华	青岛农业大学动物科技学院	80	297	9.0	13.0
4	任慧英	青岛农业大学动物科技学院	116	629	14.0	20.0
5	张灿	青岛农业大学动物科技学院	46	118	6.0	9.0
6	逯凯	青岛农业大学动物科技学院	6	7	2.0	2.0
7	韩姗姗	青岛农业大学动物科技学院	2	2	1.0	1.0