玉米纹枯病菌全长cDNA文库的构建与鉴定

• 作者: 周艳波 孔婷婷 张硕 王小皙 王敏 高增贵
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米纹枯病菌 cDNA文库 表达序列标签(EST)
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 细胞生物学、生理学、生物化学、分子生物学
• 页码范围: 603-608
• 页数: 6页
• 分类号: S432.44
• 字数: 4361字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13926/j.cnki.apps.2014.06.006

摘要

以玉米纹枯病菌菌丝为材料,利用In-Fusion SMARTerTMcDNA Lib Construction Kit构建玉米纹枯病菌全长cDNA文库.文库质量鉴定结果表明,文库滴度为1.2xl06pfu·mL-1,重组率为99.2％,插入片段平均长度大于1.0 kb.随机挑取400个白色克隆进行测序,共获得329个高质量EST序列,经聚类拼接后得到250条unique EST,包括36条contigs和214条singletons.在GenBank进行Blastn与Blastx同源比对,有227条EST与已知核酸或蛋白有不同程度的同源性,占全部EST的90.8％,其余23条无任何同源性,占9.2％.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高增贵	沈阳农业大学植物免疫研究所	148	1846	22.0	36.0
2	张硕	沈阳农业大学植物免疫研究所	10	86	5.0	9.0
3	周艳波	沈阳农业大学植物免疫研究所	32	283	9.0	16.0
4	孔婷婷	沈阳农业大学植物免疫研究所	5	17	2.0	4.0
5	王敏	沈阳农业大学植物免疫研究所	6	19	3.0	4.0
6	王小皙	沈阳农业大学植物免疫研究所	4	16	2.0	4.0