30个祖先信息位点的筛选及应用

• 作者: 万立华 叶健 李彩霞 胡兰 贾竟 魏以梁
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 分子遗传学 SNP复合检测体系 AIMs 祖先来源推断
• 年，卷（期）: 2014,（8）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 779-785
• 页数: 7页
• 字数: 4866字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2014.0779

摘要

使用一组祖先信息SNPs位点(Ancestry informative markers,AIMs)可以分析某人群的遗传成分构成,推断某个体的祖先来源.文章以HapMap数据库9个人群658份样本的分型数据为基础,从30个表型相关基因的282个SNPs位点中筛选出30个AIMs位点,基于微测序-通用芯片技术构建复合检测体系,建立人群等位基因频率数据库,用于东亚、欧洲和非洲人群遗传成分描述及个体种族来源推断.使用这组位点分析HapMap数据库中658份人群样本,初步验证位点的区分效能;使用构建的体系检验5个人群194份无关个体的DNA样本;通过Structure软件分析获取人群的成分构成以及个体的遗传成分,对个体样本进行种族来源推断.结果表明:筛选的30个AIMs位点符合哈迪温伯格平衡(P＞0.01),位点之间没有连锁(r2＜0.1),658份HapMap数据库样本和194份实验样本的祖先成分分析结果与已知结果完全一致.文章筛选并建立的30个AIMs位点复合检测体系能够有效地实现东亚、欧洲、非洲人群及其混合人群的成分构成和个体遗传成分的分析,该体系可以用于法医DNA检验中个体祖先的来源推断.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	叶健		103	481	11.0	16.0
2	胡兰		66	373	11.0	16.0
3	万立华		82	375	10.0	12.0
4	李彩霞		41	152	7.0	10.0
5	贾竟		7	29	4.0	5.0
6	魏以梁	天津医科大学基础医学研究中心	2	18	2.0	2.0