云平台下基因-基因相互作用识别算法

• 作者: 刘桂霞 李广力 李涵
• 来源期刊: 吉林大学学报（理学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 基因-基因相互作用 MapReduce模型 云计算
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 计算机科学
• 页码范围: 546-550
• 页数: 5页
• 分类号: TP311.1
• 字数: 3477字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13413/j.cnki.jdxblxb.2014.03.26

摘要

针对现有的快速方差分析算法进行并行可扩展性改进，设计一种高效的并行计算模型，并提出一种基于 MapReduce 模型的基因-基因相互作用识别算法MR-ANOVA 算法。该算法有效解决了现有基因-基因相互作用识别算法在海量数据规模下普遍存在计算复杂度过高的问题。实验结果表明，该算法充分利用了云平台的并行计算能力，随着数据量的增大，加速比逐渐接近于集群数量，可高效准确地完成基因-基因相互作用的识别。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘桂霞	吉林大学计算机科学与技术学院	35	116	6.0	8.0
2	李涵	吉林大学计算机科学与技术学院	23	116	6.0	10.0
3	李广力	吉林大学计算机科学与技术学院	6	8	2.0	2.0