基于诱导多能干细胞的Alport综合征差异性表达小核糖核酸的生物信息学分析

• 作者: 彭武建 戴勇 林小聪 陈文标 黄建溶
• 来源期刊: 中国医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: Alport综合征 小核糖核酸 GO富集 KEGG通路
• 年，卷（期）: 2014,（7）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 625-630
• 页数: 6页
• 分类号: R394-33
• 字数: 3069字
• 语种: 中文

摘要

目的 寻找Alport综合征患者(AS)与健康对照者(NC)差异性表达小核糖核酸(microRNAs).分析差异性表达microRNAs的生物信息学特点.方法 收集AS与NC组的尿液,从尿液中分离尿肾脏管细胞,将尿肾脏管细胞诱导分化成多能干细胞(iPSCs).运用高通量测序找出2组之间差异性表达的microRNAs,用于预测特异性靶基因.靶基因可进行gene ontology(GO)富集与Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)通路信号分析.确定差异性表达的microRNAs靶基因的主要富集位点与通路信号条目.结果 在2组样本中发现30个microRNAs具有差异性表达,包括19个上调与11个下调.差异性表达microRNAs靶基因GO富集主要聚集在细胞分子、细胞组成与细胞生物学过程.嘌呤代谢通路与丝裂原激活的蛋白激酶是主要的KEGG信号传导通路.结论 差异性表达microRNAs靶基因的生物信息学可能在AS发病机制中起重要作用,可作为潜在靶点用于AS病因的深入研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林小聪	广东医学院生物化学研究所	34	123	6.0	9.0
2	彭武建	深圳市第三人民医院肾脏内科	9	10	1.0	2.0