人冠状病毒 NL63中国株的全基因组克隆与序列分析

• 作者: 崔丽瑾 耿合员 谭文杰 赵莉 陆柔剑
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 关键词: HCoV-NL63 全基因组测序 系统发生分析
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 411-416
• 页数: 6页
• 字数: 3350字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0254-5101.2014.06.001

摘要

目的：对来自北京儿童医院的两份人冠状病毒NL63（human coronavirus NL63， HCoV-NL63）阳性样本进行病毒全基因组序列测定和分析。方法以荷兰株（NL63_Amsterdam 1）为参考株，设计18对包含重叠区域的、覆盖全长基因组的引物，采用病毒RNA提取、RT-PCR分段克隆测序的方法获得NL63国内株全长基因组序列；通过与其他毒株的比对分析，构建其系统发生树。结果NL63国内株基因组全长27538 bp，与参考株核苷酸相似性为99．1％，其中在1a区有连续15个碱基的缺失。系统发生分析表明，NL63目前可分为A型、B型、C型和D型共4个基因型，而国内株处在新的基因型（ D型）。结论本研究首次获得了两株NL63国内分离株的全基因组序列，进一步阐明了基因组的结构特征，对其遗传进化作了系统分析，为国内NL63病毒的分子流行病学研究提供参考。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵莉	中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒病应急技术中心	15	40	4.0	5.0
2	谭文杰	中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒病应急技术中心	89	243	9.0	12.0
3	陆柔剑	中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒病应急技术中心	20	92	6.0	9.0
4	崔丽瑾	中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒病应急技术中心	2	22	1.0	2.0
5	耿合员	中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所病毒病应急技术中心	3	4	1.0	2.0