幽门螺杆菌cag致病岛Cag Ⅰ蛋白的生物信息学分析

• 作者: 倪颖 姚逸正 徐驰 朱虹 梁广舒 田树伟 谢立苹 邵世和
• 来源期刊: 临床检验杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 幽门螺杆菌 cag致病岛 生物信息学 结构预测 功能分析
• 年，卷（期）: 2014,（11）
• 所属期刊栏目: 基础实验诊断研究
• 页码范围: 835-840
• 页数: 6页
• 分类号: R378
• 字数: 3882字
• 语种: 中文
• DOI: 10.13602/j.cnki.jcls.2014.11.11

摘要

目的 用生物信息学分析方法对幽门螺杆菌(HP) cag致病岛中的Cag Ⅰ蛋白进行综合分析,推断其结构和功能,并探索其在HP致病中的作用.方法 用antherprotV5.0软件和网络数据库等分析预测其结构,BLAST程序搜索其同源序列;用PROSITE SCAN和Fingerprint服务器分析推测其潜在的功能.结果 Cag Ⅰ蛋白有361个氨基酸残基,分子量(胁r)为39 370,理论等电点为5.56;N'端20个氨基酸残基为信号肽,有三段跨膜区,二级结构和三级结构中螺旋结构为主体(约80％);CagⅠ为稳定的疏水蛋白,保守性很强,有N-糖基化作用位点、蛋白激酶C磷酸化位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和豆蔻酰化作用位点;存在膜蛋白、菌毛蛋白、转运蛋白、ATP/GTP酶、转录调节因子、分泌系统蛋白等多个蛋白质标签.结论 Cag Ⅰ蛋白定位于HP外膜,是Ⅳ型分泌系统重要组成蛋白质,在信号转导和物质转运过程中充当信使或载体,可能具有水解酶及ATP/GTP酶活性.