基于相关分散搜索的基因表达数据双聚类

• 作者: 孙俊玲
• 来源期刊: 高技术通讯
• 关键词: 双聚类 分散搜索 微阵列技术 移动模式 缩放模式
• 年，卷（期）: 2014,（3）
• 所属期刊栏目: 计算机与通信技术
• 页码范围: 228-235
• 页数: 8页
• 字数: 6317字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3772/j.issn.1002-0470.2014.03.002

摘要

为了发现来自基因表达数据的双聚类,提出了一种相关分散搜索方法,分散搜索是一种进化技术,它以按质量和多样性指标选择的一个小解集进化为基础.该算法所用适应度函数是基于基因之间的线性相关性来检测基因的移动和缩放模式,同时为了选择正相关基因,采用了一个改进方法.该算法已用酵母细胞周期数据集、人类B细胞淋巴瘤数据集和酵母应力数据集三个真实数据集进行了测试,同时与使用基因本体数据库的CC,OPSM,ISA,BiMax和Samba等方法进行了比较.实验结果表明该算法能发现大量移动和缩放模式双聚类.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙俊玲	武汉大学计算机学院	22	42	4.0	5.0