贵州本地山羊JAK2基因5’调控区SNP生物信息学分析

• 作者: 刘若余 孙岩岩 杨永强 焦仁刚 谢海强 龚俞
• 来源期刊: 中国畜牧杂志
• 学科: 农学
• 关键词: JAK2 SNP 启动子 贵州白山羊 贵州黑山羊 黔北麻羊
• 年，卷（期）: 2014,（15）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 分类号: S827.2
• 字数: 3336字
• 语种: 中文

摘要

本实验旨在从贵州本地山羊JA K2基因启动子区查找SNP,并分析其在启动子区中的作用.以贵州当地优良品种贵州白山羊、贵州黑山羊及黔北麻羊3种山羊构建不同DNA池,双向测序筛选SNP位点,降低测序误差.结果表明:JAK2基因5’调控区存在5个SNPs位点,分别为G-278C、G-275C、C-265G、A-193G和G-43T;各生物信息学在线软件预测获得JAK2基因核心启动子范围及CpG岛位置,单核苷酸多态性位点导致附近大量转录因子新位点产生和原来结合位点消失,但并不改变CpG岛大小.结果提示,JAK2基因5’调控区存在5个对启动子功能元件有较大影响的SNP位点,该结果为进一步了解JAK2基因启动子区功能元件奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	龚俞		15	23	3.0	3.0
2	焦仁刚		14	32	3.0	5.0
3	杨永强	贵州大学动物科学学院贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室	9	23	3.0	4.0
4	谢海强	贵州大学动物科学学院贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室	2	3	1.0	1.0
5	孙岩岩	贵州大学动物科学学院贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室	6	10	2.0	3.0