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摘要:
【目的】内切多聚半乳糖醛酸酶(endo polygalacturonases,endoPGs)是重要的致病因子之一。论文从烟草靶斑病菌(Rhizoctonia solani)强致病力菌株YC-9和弱致病菌株LF-2中克隆该致病基因,分析比较该基因的序列特征、进化关系和表达特性,研究其在与烟草互作过程的致病作用。【方法】通过比较GenBank中不同植物病原真菌的endoPGs序列设计简并引物,首先获得菌株YC-9及LF-2的endoPGs基因片段,再采用RACE技术克隆获得其cDNA全长序列;生物信息学分析比较其保守结构域及序列特征;采用MEGA 4.0软件构建endoPGs的系统进化树;通过real-time RT-PCR技术对强致病力菌株YC-9及弱致病力菌株LF-2的endoPGs与烟草K326互作的表达特性进行研究。【结果】克隆获得了烟草靶斑病菌强致病力菌株YC-9和弱致病力菌株LF-2的endoPGs的cDNA全长序列,分别命名为endoPG1和endoPG2,开放阅读框(ORF)长度均为1086 bp,编码361个氨基酸;比较分析表明endoPG1和endoPG2的推测蛋白均具有PLNO3003基因家族保守结构域,其跨膜结构间存在差异;成功构建了该基因系统进化树,结果表明来自烟草靶斑病菌的endoPGs构成独立分支,且烟草靶斑病菌endoPG1及endoPG2同源关系最近;real-time RT-PCR表达特性分析结果显示,靶斑病菌endoPG1和endoPG2与烟草互作(接种)之后该基因的表达与未互作(不接种)的对照样品相比均呈明显上调趋势,同时 endoPG1表达迅速且高于endoPG2。【结论】烟草靶斑病菌强致病力菌株 YC-9及弱致病力菌株 LF-2的内切多聚半乳糖醛酸酶基因均具有PLNO3003基因家族的保守结构域,其推测蛋白的跨膜结构间存在差异,该推测蛋白与烟草靶斑病菌同源关系最近,且endoPG1和endoPG2的推测蛋白的同源性最高;内切多聚半乳糖醛酸酶基因的表达受与烟草互作的诱导,在不同致病力菌株中存在明显差异。
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文献信息
篇名 烟草靶斑病菌内切多聚半乳糖醛酸酶基因endoPGs的克隆及表达特征分析
来源期刊 中国农业科学 学科
关键词 烟草靶斑病菌 内切多聚半乳糖醛酸酶基因 克隆 基因表达
年,卷(期) 2014,(10) 所属期刊栏目 植物保护
研究方向 页码范围 1939-1946
页数 8页 分类号
字数 语种 中文
DOI 10.3864/j.issn.0578-1752.2014.10.007
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 吴元华 沈阳农业大学植物保护学院 159 2074 24.0 38.0
2 赵秀香 沈阳农业大学植物保护学院 85 876 18.0 25.0
3 赵艳琴 沈阳农业大学植物保护学院 19 77 5.0 7.0
7 伏颖 沈阳农业大学植物保护学院 10 52 5.0 6.0
8 安梦楠 沈阳农业大学植物保护学院 17 34 3.0 5.0
9 陈建光 沈阳农业大学植物保护学院 6 29 3.0 5.0
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研究主题发展历程
节点文献
烟草靶斑病菌
内切多聚半乳糖醛酸酶基因
克隆
基因表达
研究起点
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研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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中国农业科学
半月刊
0578-1752
11-1328/S
大16开
北京中关村南大街12号
2-138
1960
chi
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