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烟草靶斑病菌内切多聚半乳糖醛酸酶基因endoPGs的克隆及表达特征分析
烟草靶斑病菌内切多聚半乳糖醛酸酶基因endoPGs的克隆及表达特征分析
作者:
伏颖
吴元华
安梦楠
赵秀香
赵艳琴
陈建光
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
烟草靶斑病菌
内切多聚半乳糖醛酸酶基因
克隆
基因表达
摘要:
【目的】内切多聚半乳糖醛酸酶(endo polygalacturonases,endoPGs)是重要的致病因子之一。论文从烟草靶斑病菌(Rhizoctonia solani)强致病力菌株YC-9和弱致病菌株LF-2中克隆该致病基因,分析比较该基因的序列特征、进化关系和表达特性,研究其在与烟草互作过程的致病作用。【方法】通过比较GenBank中不同植物病原真菌的endoPGs序列设计简并引物,首先获得菌株YC-9及LF-2的endoPGs基因片段,再采用RACE技术克隆获得其cDNA全长序列;生物信息学分析比较其保守结构域及序列特征;采用MEGA 4.0软件构建endoPGs的系统进化树;通过real-time RT-PCR技术对强致病力菌株YC-9及弱致病力菌株LF-2的endoPGs与烟草K326互作的表达特性进行研究。【结果】克隆获得了烟草靶斑病菌强致病力菌株YC-9和弱致病力菌株LF-2的endoPGs的cDNA全长序列,分别命名为endoPG1和endoPG2,开放阅读框(ORF)长度均为1086 bp,编码361个氨基酸;比较分析表明endoPG1和endoPG2的推测蛋白均具有PLNO3003基因家族保守结构域,其跨膜结构间存在差异;成功构建了该基因系统进化树,结果表明来自烟草靶斑病菌的endoPGs构成独立分支,且烟草靶斑病菌endoPG1及endoPG2同源关系最近;real-time RT-PCR表达特性分析结果显示,靶斑病菌endoPG1和endoPG2与烟草互作(接种)之后该基因的表达与未互作(不接种)的对照样品相比均呈明显上调趋势,同时 endoPG1表达迅速且高于endoPG2。【结论】烟草靶斑病菌强致病力菌株 YC-9及弱致病力菌株 LF-2的内切多聚半乳糖醛酸酶基因均具有PLNO3003基因家族的保守结构域,其推测蛋白的跨膜结构间存在差异,该推测蛋白与烟草靶斑病菌同源关系最近,且endoPG1和endoPG2的推测蛋白的同源性最高;内切多聚半乳糖醛酸酶基因的表达受与烟草互作的诱导,在不同致病力菌株中存在明显差异。
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文献信息
篇名
烟草靶斑病菌内切多聚半乳糖醛酸酶基因endoPGs的克隆及表达特征分析
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
烟草靶斑病菌
内切多聚半乳糖醛酸酶基因
克隆
基因表达
年,卷(期)
2014,(10)
所属期刊栏目
植物保护
研究方向
页码范围
1939-1946
页数
8页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2014.10.007
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
吴元华
沈阳农业大学植物保护学院
159
2074
24.0
38.0
2
赵秀香
沈阳农业大学植物保护学院
85
876
18.0
25.0
3
赵艳琴
沈阳农业大学植物保护学院
19
77
5.0
7.0
7
伏颖
沈阳农业大学植物保护学院
10
52
5.0
6.0
8
安梦楠
沈阳农业大学植物保护学院
17
34
3.0
5.0
9
陈建光
沈阳农业大学植物保护学院
6
29
3.0
5.0
传播情况
被引次数趋势
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(/年)
引文网络
引文网络
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共引文献
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参考文献
(19)
节点文献
引证文献
(5)
同被引文献
(15)
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引证文献(1)
二级引证文献(1)
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引证文献(0)
二级引证文献(3)
2018(9)
引证文献(1)
二级引证文献(8)
2019(7)
引证文献(1)
二级引证文献(6)
2020(2)
引证文献(1)
二级引证文献(1)
研究主题发展历程
节点文献
烟草靶斑病菌
内切多聚半乳糖醛酸酶基因
克隆
基因表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
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