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摘要:
从 DNA序列片段个案中密码子分布密度角度出发,提取出DNA序列片段的特征,基于氨基酸分子中侧链基极性性质把氨基酸分成5大类,计算5大类出现的频率,这种考虑生物意义的特征提取方法不仅考虑碱基的含量,还在一定程度上考虑碱基的排列顺序,应用层次聚类分析方法和 BP神经网络法对DNA序列片段进行分类。结果表明,2类算法分类结果精度较高,且一致性也较高。说明这种特征提取法比传统的单纯考虑碱基的特征提取法效果更优。
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文献信息
篇名 基于氨基酸分子中侧链基极性性质的DNA序列分类
来源期刊 农业科学与技术(英文版) 学科
关键词 密码子 频率 层次聚类分析 BP神经网络法
年,卷(期) 2014,(5) 所属期刊栏目 分子生物学?组织培养
研究方向 页码范围 751-755
页数 5页 分类号
字数 2045字 语种 英文
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1 王显金 23 44 3.0 6.0
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研究主题发展历程
节点文献
密码子
频率
层次聚类分析
BP神经网络法
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
农业科学与技术(英文版)
双月刊
1009-4229
43-1422/S
16开
长沙市芙蓉区湖南省农业信息与工程研究所
42-209
2000
eng
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5310
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