hsa-miR-126的靶基因预测及功能分析

• 作者: 卢敏南 廖泽容 徐天勇 者明伟 赵洪波 陈波
• 来源期刊: 昆明医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: hsa-miR-126 微小RNA 生物信息学 靶基因 功能
• 年，卷（期）: 2014,（11）
• 所属期刊栏目: 基础医学
• 页码范围: 4-9
• 页数: 6页
• 分类号: R318.04
• 字数: 2513字
• 语种: 中文

摘要

目的 检测hsa-miR-126在各个组织器官中的表达情况,通过生物信息学预测hsa-miR-126的靶基因,进一步分析其可能功能,为研究hsa-miR-126的功能和机制奠定基础.方法 通过miRGator v3.0数据库查看hsa-miR-126在各个组织器官中的表达丰度情况;应用TargetScan、DIANA-microT-CDS及miRanda预测hsa-miR-126的靶基因;将预测所得靶基因和已证实的靶基因交集组成的基因集合分别进行功能富集分析(GO analysis)和信号转导通路富集分析,分析hsa-miR-126的可能功能.结果 hsa-miR-126在胃肠道,心脏,肾脏,肝胆系统,肺,干细胞,睾丸,胸腺,甲状腺,子宫中表达丰度较高;结合已被证实靶基因得到40个候选靶基因;靶基因主要参与细胞迁移调控以及腺体发育相关生物过程,涉及数个癌症通路和与癌症发生相关的信号通路,以及神经营养因子信号通路,ErbB信号通路,趋化因子信号通路和VEGF信号通路等.结论 hsa-miR-126预测的靶基因集合富集于多个生物学过程,与肿瘤和血管性疾病密切相关,生物信息预测结果为今后的研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐天勇	昆明医科大学科研实验中心	16	29	3.0	3.0
2	陈波	昆明医科大学科研实验中心	19	34	4.0	4.0
3	卢敏南	昆明医科大学科研实验中心	10	26	4.0	4.0
4	廖泽容	昆明医科大学现代教育技术中心	14	20	3.0	4.0
5	赵洪波	昆明医科大学临床医学研究院	10	18	2.0	3.0
7	者明伟	昆明医科大学现代教育技术中心	10	9	2.0	2.0