人类miR－22靶基因生物信息学预测及功能分析

• 作者: 刘曙光 周有俭 徐胜美 李静 王新根 郭东 韩京军 马红梅
• 来源期刊: 广西医学
• 学科: 生物学
• 关键词: 人类miR-22 微小RNA 靶基因 功能富集分析 生物通路富集分析 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 论著? 基础研究
• 页码范围: 891-894
• 页数: 4页
• 分类号: Q786
• 字数: 3274字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11675/j.issn.0253-4304.2015.07.03

摘要

目的：应用生物信息学技术分析预测人类miR－22（ hsa－miR－22）的靶基因并分析其功能，为深入研究hsa－miR－22的生物学功能和调控机制提供理论指导。方法利用PubMed检索miR－22相关文章，明确其部分已知功能及已证实的靶基因，通过miRBase获得miR－22序列和基因组特征。应用miRWalk综合数据库中4种工具对hsa－miR－22靶基因进行预测并取交集，对预测的靶基因集合结合已证实的靶基因进行功能富集分析（ GO分析）以及KEGG生物通路富集分析。结果 miR－22序列在多物种间具有一定的保守性。通过PubMed检索获得已证实靶基因20个，miRWalk综合数据库预测的靶基因集合共194个。 GO分析结果显示hsa－miR－22靶基因功能主要富集于转录调控、蛋白修饰、生物合成和形态发生等过程（P＜0．01）；KEGG生物通路主要富集于细胞外基质受体相互作用、黏着斑、肌动蛋白细胞骨架调节、ErbB信号通路、mTOR信号通路以及前列腺癌、子宫内膜癌、急性髓系白血病、胶质瘤和黑色素瘤疾病信号通路（P＜0．05）。结论 hsa－miR－22的靶基因集合富集于多个生物学过程及疾病信号通路，与多种肿瘤密切相关。