草菇泰国1号菌株交配型A因子分子遗传学及生物信息学解析

• 作者: 冯爱萍 汪虹 谭琦 陈明杰 鲍大鹏
• 来源期刊: 食用菌学报
• 关键词: 草菇 A交配型基因 同源异形结构域蛋白
• 年，卷（期）: 2015,（1）
• 页码范围: 1-7
• 页数: 7页
• 字数: 3670字
• 语种: 中文
• DOI: j.cnki/1005-9873.2015.01.001

摘要

采用简并PCR引物获得mip基因保守片段后,通过长片段PCR技术从草菇(Volvariella volvacea)菌株泰国1号孢子单核体中扩增获得了A1、A2交配型位点的DNA序列,结果表明:每个交配型位点均含2个交配型基因(HD1和HD2),其中A1位点的交配型基因为HD1-A1-TG和HD2-AI-TG,长度分别为1341 bp和1450 bp,各编码446和429个氨基酸残基;A2位点的交配型基因为HD1-A2-TG和HD2-A2-TG,长度分别为1442 bp和1501 bp,各编码463和443个氨基酸残基.利用生物信息学方法分析了泰国1号及另外两株草菇代表性菌株V23和屏优的交配型基因编码的HD蛋白序列,结果表明:HD蛋白均含有同源异形结构域.根据系统进化树可以看出,泰国1号与V23、屏优菌株A位点HD1和HD2基因序列所编码的氨基酸序列之间亲缘关系复杂,可能具有不同的起源.