荧光定量RT-PCR检测柯萨奇病毒A组6和10型的方法建立及应用

• 作者: 吕莉琨 李佳萌 李力 杨东靖 苏旭 谭昭麟
• 来源期刊: 国际病毒学杂志
• 关键词: 手足口病 柯萨奇病毒A组6型 柯萨奇病毒A组10型 荧光定量RT-PCR
• 年，卷（期）: 2015,（6）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 372-375
• 页数: 4页
• 字数: 2846字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1673-4092.2015.06.003

摘要

目的 建立柯萨奇病毒A组6(Coxsackievirus A6,CVA6)和10型(CVA10)的SYBRGreen Ⅰ荧光定量RT-PCR方法并进行评价及初步应用.方法 根据GenBank上的CVA6和CVA10序列,分别设计特异性引物,建立SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR方法体系,并分别进行灵敏度,重复性和特异性检测,然后利用该方法对649份2014年天津市未明确分型的肠道病毒阳性标本进行检测.结果 成功建立CVA6和CVA10的SYBR GreenⅠ荧光定量RT-PCR方法及定量标准曲线,其检出限均为101 copies/μL,重复性实验的变异系数均小于2％.该方法特异性强,与柯萨奇病毒(A组2、4、5、16型)、肠道病毒EV71型、诺如病毒、轮状病毒、麻疹病毒和乙型流感病毒均无交叉反应.利用该方法检测649份未分型标本,发现136份为CVA6阳性和174份为CVA10阳性,分别占未分型阳性标本的20.96％和26.81％.结论 本研究建立的检测CVA6和CVA10荧光定量RT-PCR方法灵敏度高、重复性好、特异性强,应用于2014年天津市手足口病监测,发现C VA6和CVA10已成为优势型病原体.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨东靖	天津天津市疾病预防控制中心病原生物检测所	2	4	1.0	2.0
2	李力	天津天津市疾病预防控制中心病原生物检测所	2	4	1.0	2.0
3	吕莉琨	天津天津市疾病预防控制中心病原生物检测所	2	4	1.0	2.0
4	李佳萌	天津天津市疾病预防控制中心病原生物检测所	2	4	1.0	2.0
5	谭昭麟	天津天津市疾病预防控制中心病原生物检测所	2	4	1.0	2.0
6	苏旭	天津天津市疾病预防控制中心病原生物检测所	2	4	1.0	2.0