河南省猪戊型肝炎病毒HN-JY40的全基因组序列测定及分析

• 作者: 张亲 张小霞 梁振普 许锋 邵新峰
• 来源期刊: 病毒学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪戊型肝炎病毒HN-JY40 RT-PCR 3'RACE 5'RACE 序列分析 同源性
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 231-238
• 页数: 8页
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文

摘要

本文旨在测定猪戊型肝炎病毒HN-JY40株的全基因组序列,并对其序列特征和进化关系进行分析.设计8对引物,利用RT-PCR、3 ' RACE和5 ' RACE技术得到了戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)河南分离株HN-JY40的近似全基因组序列,命名为“HN-JY40”;用Expasy、Megalign、Clustal X和MEGA 4等生物学软件进行序列分析、同源比对和进化树的构建.测序得到的HN-JY40序列去除polyA后全长7 223 bp,5 ' UTR有9个碱基,3 ' UTR全长69 bp.ORF1(5 124 bp)编码1 707个氨基酸,ORF2(2 025 bp)编码674个氨基酸,ORF3(345 bp)编码114个氨基酸.全基因组相似性分析发现,HN-JY40为典型的基因4型病毒,且属于一个新亚型.猪HN JY40ORF1的部分核苷酸(153～432 bp)与人源HK104-2004同源性高达到96％,为揭示戊型肝炎的跨种传播提供了新的分子生物学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁振普		32	186	8.0	12.0
2	张小霞		25	110	6.0	9.0
3	邵新峰		4	4	2.0	2.0
4	张亲		3	0	0.0	0.0
5	许锋		7	39	3.0	6.0