Fancd2os基因及其编码蛋白的生物信息学分析和表达谱鉴定

• 作者: 李婷 李晓宾 杨红 温丽敏 王海龙 白欣艳 贾三三 郭睿
• 来源期刊: 中国生物制品学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: Fancd2os 生物信息学 表达谱 小鼠 睾丸 基因表达
• 年，卷（期）: 2015,（7）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 670-676
• 分类号: R73-3|Q-31
• 语种: 中文

摘要

目的 利用生物信息学手段对Fancd2os基因及其编码蛋白进行结构分析和功能预测,并检测该基因在小鼠组织中的表达.方法 利用生物信息学分析软件和技术对该基因及其编码蛋白的同源性、结构定位、理化性质及表达谱等特征进行分析和比对;采用半定量RT-PCR、实时定量PCR及Western blot法分别检测Fancd2os mRNA及其编码蛋白在雄性小鼠不同组织以及不同发育阶段睾丸组织的表达;利用免疫组织化学染色方法检测Fancd2os蛋白在小鼠曲细精管中的细胞定位.结果 生物信息学分析表明小鼠Fancd2os蛋白的氨基酸系列与人、大鼠和牛的同源性分别为92.1％、97.8％和93.3％,该蛋白主要定位在细胞浆,二级结构以无规则卷曲和仅螺旋为主,无信号肽,含有多个磷酸化位点;EST电子表达谱显示该基因主要在睾丸组织中表达;GEO数据库分析提示Fancd2os基因的表达可能与线粒体ClpP蛋白酶的表达密切相关;MGI Interaction Explorer数据库检索发现Fancd2os基因与95个miRNA具有相互作用.Fancd2os基因及其编码蛋白在小鼠睾丸组织中表达量高,且具有明显的时序性,以8周龄小鼠表达水平最高;Fancd2os蛋白主要定位于曲细精管精母细胞和圆形精子细胞的胞质中.结论 Fancd2os基因为小鼠睾丸组织高表达基因,其表达水平随着睾丸的发育过程呈上调趋势,结合生物信息学分析结果,该基因可能与睾丸的发育及生精过程相关.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王海龙	山西医科大学基础医学院	60	295	9.0	14.0
2	杨红	山西医科大学基础医学院	51	210	7.0	12.0
3	郭睿	山西医科大学基础医学院	37	117	7.0	8.0
4	李婷	山西医科大学基础医学院	15	65	6.0	7.0
5	李晓宾	山西医科大学基础医学院	3	12	2.0	3.0
6	贾三三	山西医科大学基础医学院	2	11	2.0	2.0
7	温丽敏	山西医科大学基础医学院	4	12	2.0	3.0
8	白欣艳	山西医科大学基础医学院	4	12	2.0	3.0