Pseudomonas syringae褐藻胶裂解酶基因的克隆及信息学分析

• 作者: 倪辉 刘韩 吴丽云 朱艳冰 肖安风 蔡慧农
• 来源期刊: 集美大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 假单胞菌 褐藻胶裂解酶 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2015,（3）
• 所属期刊栏目: 水产、食品与生物技术
• 页码范围: 179-185
• 页数: 7页
• 分类号: Q939.97
• 字数: 3729字
• 语种: 中文

摘要

以Pseudomonas syringae的基因组为模板,使用褐藻胶裂解酶引物进行PCR扩增,将目的基因克隆至pMD18-T载体后进行测序.结果显示,克隆基因的大小为1137 bp,预测编码含有378个氨基酸残基的蛋白质.对该蛋白质进一步进行生物信息学分析,结果表明,该蛋白质序列与其他菌株来源的褐藻胶裂解酶具有高的相似性,预测本研究克隆的基因编码褐藻胶裂解酶.该褐藻胶裂解酶的理论分子质量为42.5 ku,理论等电点为8.15.采用同源建模法建立P.syringae褐藻胶裂解酶的三维结构,富含螺旋结构.