猪miR-192/-215的组织表达谱及其关键靶基因分析

• 作者: 包文斌 吴圣龙 吴正常 夏日炜 孙丽 殷学梅 霍永久
• 来源期刊: 中国农业科学
• 关键词: 猪 miR-192 miR-215 组织表达谱 靶基因 E.coliF18
• 年，卷（期）: 2015,（11）
• 所属期刊栏目: 畜牧?兽医?资源昆虫
• 页码范围: 2251-2261
• 页数: 11页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2015.11.016

摘要

【目的】在前期通过Illumina Solexa高通量测序技术并结合荧光定量验证筛选出断奶仔猪E.coli F18菌株感染下表达量极显著上调的microRNAs—miR-192和miR-215的基础上，为了解miR-192和miR-215的组织表达情况，进一步筛选确定miR-192和miR-215靶向调控E.coli F18菌株感染的关键靶基因，为探讨miR-192和miR-215调控断奶仔猪E.coliF18感染的分子调控机制奠定基础。【方法】试验采用Real-time PCR方法检测miR-192和miR-215在35日龄梅山仔猪各个组织中的分布情况，同时利用MEGA 5.0分析了其保守性，TargetScan预测miR-192和miR-215的靶基因，并对靶基因分别进行Gene Ontology和Pathway通路的富集分析，进一步利用DAVID对靶基因蛋白进行功能分类，最后将预测的靶基因与课题组前期筛选出的断奶仔猪E.coli F18感染抗性相关的调控基因取交集。【结果】miR-192和miR-215在35日龄梅山仔猪十二指肠和空肠中均高度表达，二者成熟序列在脊椎动物中高度保守。miR-192和miR-215对应的靶基因相同，具有156个靶基因，只在轴突导向通路（axon guidance pathway）显著富集（P-value <0.05）以及25个GO功能中显著富集（P-value <0.05）。靶基因蛋白按功能分为12类，其中信号转导功能的磷蛋白（phosphoprotein）和DNA结合蛋白（dna-binding）占主要部分。靶基因与前期筛选的E.coli F18感染抗性相关的调控基因（GEO登录号：GSE26854）取交集，发现DLG5、ALCAM、FRMD4B、MIPOL1和ZFHX3等5个基因为miR-192和miR-215的重要靶基因，其中DLG5为维持小肠上皮细胞结构完整性的重要因子。【结论】miR-192与 miR-215是参与维持断奶仔猪肠道正常功能与抗 F18大肠杆菌感染的重要因子，DLG5可能是miR-192和miR-215靶向调控E.coli F18菌株感染中关键的靶基因，今后需要进一步验证其能否作为梅山猪抗F18大肠杆菌的有效遗传标记。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	包文斌	扬州大学动物科学与技术学院	132	942	16.0	25.0
2	吴圣龙	扬州大学动物科学与技术学院	95	641	14.0	20.0
3	霍永久	扬州大学动物科学与技术学院	77	420	11.0	16.0
4	吴正常	扬州大学动物科学与技术学院	12	45	4.0	6.0
5	殷学梅	扬州大学动物科学与技术学院	7	43	3.0	6.0
6	夏日炜	扬州大学动物科学与技术学院	13	46	4.0	5.0
7	孙丽	扬州大学动物科学与技术学院	10	73	4.0	8.0