基于图元向量的差异共表达分析研究

• 作者: 刘文斌 李先斌 肖碧玉
• 来源期刊: 电子学报
• 关键词: 图元向量 差异网络 小鼠衰老
• 年，卷（期）: 2015,（10）
• 所属期刊栏目: 学术论文
• 页码范围: 2009-2013
• 页数: 5页
• 字数: 3484字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0372-2112.2015.10.019

摘要

差异分析对于揭示生命体的生长、发育和衰老过程及疾病发生具有重大的意义，基于网络的差异分析方法已经成为系统生物学的一个研究热点．Przulj 提出的图元及图元向量作为一描述网络局部结构信息的方法，已经在网络分析方法面取得了很多重要的结果．本文在图元向量的基础上提出了二种节点变化的差距度量方法，通过聚类可以分别挖掘网络中模块内变化基因簇和模块间变化基因簇．应用 AGEMAP 数据库中12个小鼠组织基因表达数据的结果表明：大部分聚类簇都高度显著富集与衰老相关的 GO 条目．