拟南芥花药基因的共表达分析

• 作者: 刘太岗 焦清局 连爱娥 郑小琪 黄继风
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 生物学
• 关键词: 拟南芥 花药 共表达 最大团 ATTED-II数据库
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 350-355
• 分类号: Q23
• 字数: 6737字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2010.04.017

摘要

运用图论中最大团算法,对ATTED-II数据库中提供的拟南芥共表达数据进行分析,为进一步研究基因功能提供了较为可靠的数据.文中提出的算法首先根据芯片数据鉴定拟南芥花药基因,然后以ATTED-II数据库为基础构建每一个花药基因的共表达网络,最后利用最大团算法从共表达网络中挖掘共表达数据.基于这种方法,系统地分析了每一个拟南芥花药基因的共表达情况,有助于拟南芥花药发育分子机理和基因转录调控的深入研究.实验验证这种方法对拟南芥花药共表达基因的提取十分有效.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄继风	上海师范大学计算机科学与技术系	55	243	8.0	12.0
2	郑小琪	上海师范大学数理学院	5	12	2.0	3.0
3	焦清局	上海师范大学计算机科学与技术系	2	2	1.0	1.0
4	刘太岗	大连理工大学数学科学学院	1	2	1.0	1.0
5	连爱娥	上海师范大学计算机科学与技术系	1	2	1.0	1.0