比较图元向量和点的聚类系数对差异网络的研究

• 作者: 刘文斌 李先彬 沈良忠 肖碧玉
• 来源期刊: 生物信息学
• 学科: 医学
• 关键词: 差异网络 点的聚类系数 图元向量 小鼠衰老
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 264-270
• 页数: 7页
• 分类号: R978.1+6
• 字数: 5064字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-5565.2013.04.04

摘要

差异分析对于揭示生命体的生长、发育和衰老过程及疾病发生具有重大的意义,基于网络的差异分析方法已经成为系统生物学的一个研究热点.网络节点往往通过与局部结构作用实现某种功能,其与局部结构的关系变化,很可能影响其功能.本文利用仿真实验的方法比较了图元向量和点的聚类系数两种局部结构测度的性能,并且利用他们分别设计算法挖掘差异网络中模块化变化的基因簇.应用AGEMAP数据库中小鼠12个组织基因表达数据进行实验,大部分聚类簇都高度显著富集与衰老相关的GO项.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘文斌	温州大学物理与电子信息工程学院	36	152	6.0	11.0
2	沈良忠	温州大学物理与电子信息工程学院	21	66	5.0	7.0
3	肖碧玉	温州大学物理与电子信息工程学院	2	1	1.0	1.0
4	李先彬	温州大学物理与电子信息工程学院	1	1	1.0	1.0