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摘要:
WRKY蛋白是目前被广泛研究的一类DNA 特异结合转录因子,在植物次生代谢物生物合成、植物生长和发育及衰老等生理过程以及生物、非生物防御反应中起重要的调控作用.该研究从滇龙胆幼叶中克隆萜类合成的关键转录因子基因GrWRKY5,并利用生物信息学方法对基因功能进行预测,构建植物过表达载体.结果表明:根据三年生滇龙胆转录组 GrWRKY5基因序列,设计特异性引物,通过 RT-PCR 扩增GrWRKY5 ORF序列,并进行 TA 克隆、测序和序列分析;构建入门载体 pENTRTM2B-GrWRKY5,经 LR 反应后构建植物过表达载体.GrWRKY5 ORF全长591 bp,编码196个氨基酸,GenBank登录号为KF922375,其中第167与170之间的色氨酸(W)、精氨酸(R)、赖氨酸(K)、酪氨酸(Y)组成 WRKY 蛋白所特有的“WRKY”结构.序列分析表明GrWRKY5是 WRKY 超家族的成员.经生物信息学在线软件分析发现, GrWRKY5的等电点为6.29,脂肪族指数为61.37,不稳定指数为57.80.总平均疏水性为-0.708,为亲水蛋白;含有20种氨基酸,其中天冬氨酸(Asp)和脯氨酸(Pro)含量最高,为8.1%;半胱氨酸(Cys)含量最低,仅为1.0%.氨基酸序列系统发育分析表明,GrWRKY5与拟南芥中 WRKY 家族中遗传距离最接近的是WRKY27,属于Ⅱe 类成员;与 CrWRKY22和 VvWRKY22蛋白的亲缘关系较近;与 JcWRKY47和 Tc-WRKY27亲缘关系较远;BLASTp结果显示,GrWRKY5与欧洲油菜BnWRKY27-1的同源性最高(为69%);与拟南芥AaWRKY22的一致性最低(仅为31%).以Gateway入门载体pENTR2B和目的载体 pK2GW7为基础,成功构建了植物过表达载体pK2-35S-GrWRKY5,该载体的成功构建为该基因在拟南芥、滇龙胆等植物中的遗传转化奠定了基础,同时为WRKY基因功能的深入研究提供依据.
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文献信息
篇名 滇龙胆GrWRKY5基因的克隆和植物表达载体构建
来源期刊 广西植物 学科 生物学
关键词 滇龙胆 GrWRKY5 基因克隆 序列分析 植物表达载体构建
年,卷(期) 2015,(5) 所属期刊栏目 遗传与育种
研究方向 页码范围 741-747
页数 7页 分类号 Q943.2|Q786
字数 4557字 语种 中文
DOI 10.11931/guihaia.gxzw201312034
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王元忠 云南省农业科学院药用植物研究所 162 905 14.0 19.0
2 李涛 玉溪师范学院资源环境学院 70 340 10.0 12.0
3 李富生 云南农业大学农学与生物技术学院 84 686 15.0 23.0
4 王彩云 云南农业大学农学与生物技术学院 5 28 3.0 5.0
6 张晓东 玉溪师范学院资源环境学院 31 71 5.0 7.0
7 李彩霞 玉溪师范学院资源环境学院 19 43 4.0 6.0
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研究主题发展历程
节点文献
滇龙胆
GrWRKY5
基因克隆
序列分析
植物表达载体构建
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广西植物
月刊
1000-3142
45-1134/Q
大16开
广西桂林市雁山镇85号广西植物研究所《广西植物》编辑部
48-43
1981
chi
出版文献量(篇)
3580
总下载数(次)
1
总被引数(次)
42592
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导