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滇龙胆GrWRKY5基因的克隆和植物表达载体构建
滇龙胆GrWRKY5基因的克隆和植物表达载体构建
作者:
张晓东
李富生
李彩霞
李涛
王元忠
王彩云
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
滇龙胆
GrWRKY5
基因克隆
序列分析
植物表达载体构建
摘要:
WRKY蛋白是目前被广泛研究的一类DNA 特异结合转录因子,在植物次生代谢物生物合成、植物生长和发育及衰老等生理过程以及生物、非生物防御反应中起重要的调控作用.该研究从滇龙胆幼叶中克隆萜类合成的关键转录因子基因GrWRKY5,并利用生物信息学方法对基因功能进行预测,构建植物过表达载体.结果表明:根据三年生滇龙胆转录组 GrWRKY5基因序列,设计特异性引物,通过 RT-PCR 扩增GrWRKY5 ORF序列,并进行 TA 克隆、测序和序列分析;构建入门载体 pENTRTM2B-GrWRKY5,经 LR 反应后构建植物过表达载体.GrWRKY5 ORF全长591 bp,编码196个氨基酸,GenBank登录号为KF922375,其中第167与170之间的色氨酸(W)、精氨酸(R)、赖氨酸(K)、酪氨酸(Y)组成 WRKY 蛋白所特有的“WRKY”结构.序列分析表明GrWRKY5是 WRKY 超家族的成员.经生物信息学在线软件分析发现, GrWRKY5的等电点为6.29,脂肪族指数为61.37,不稳定指数为57.80.总平均疏水性为-0.708,为亲水蛋白;含有20种氨基酸,其中天冬氨酸(Asp)和脯氨酸(Pro)含量最高,为8.1%;半胱氨酸(Cys)含量最低,仅为1.0%.氨基酸序列系统发育分析表明,GrWRKY5与拟南芥中 WRKY 家族中遗传距离最接近的是WRKY27,属于Ⅱe 类成员;与 CrWRKY22和 VvWRKY22蛋白的亲缘关系较近;与 JcWRKY47和 Tc-WRKY27亲缘关系较远;BLASTp结果显示,GrWRKY5与欧洲油菜BnWRKY27-1的同源性最高(为69%);与拟南芥AaWRKY22的一致性最低(仅为31%).以Gateway入门载体pENTR2B和目的载体 pK2GW7为基础,成功构建了植物过表达载体pK2-35S-GrWRKY5,该载体的成功构建为该基因在拟南芥、滇龙胆等植物中的遗传转化奠定了基础,同时为WRKY基因功能的深入研究提供依据.
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内容分析
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文献信息
篇名
滇龙胆GrWRKY5基因的克隆和植物表达载体构建
来源期刊
广西植物
学科
生物学
关键词
滇龙胆
GrWRKY5
基因克隆
序列分析
植物表达载体构建
年,卷(期)
2015,(5)
所属期刊栏目
遗传与育种
研究方向
页码范围
741-747
页数
7页
分类号
Q943.2|Q786
字数
4557字
语种
中文
DOI
10.11931/guihaia.gxzw201312034
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王元忠
云南省农业科学院药用植物研究所
162
905
14.0
19.0
2
李涛
玉溪师范学院资源环境学院
70
340
10.0
12.0
3
李富生
云南农业大学农学与生物技术学院
84
686
15.0
23.0
4
王彩云
云南农业大学农学与生物技术学院
5
28
3.0
5.0
6
张晓东
玉溪师范学院资源环境学院
31
71
5.0
7.0
7
李彩霞
玉溪师范学院资源环境学院
19
43
4.0
6.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(0)
共引文献
(0)
参考文献
(12)
节点文献
引证文献
(0)
同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
1994(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
2000(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
2002(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
2004(2)
参考文献(2)
二级参考文献(0)
2005(1)
参考文献(1)
二级参考文献(0)
2009(2)
参考文献(2)
二级参考文献(0)
2010(2)
参考文献(2)
二级参考文献(0)
2012(2)
参考文献(2)
二级参考文献(0)
2015(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
滇龙胆
GrWRKY5
基因克隆
序列分析
植物表达载体构建
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
广西植物
主办单位:
广西壮族自治区广西植物研究所
中国科学院广西植物研究所
广西植物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-3142
CN:
45-1134/Q
开本:
大16开
出版地:
广西桂林市雁山镇85号广西植物研究所《广西植物》编辑部
邮发代号:
48-43
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
3580
总下载数(次)
1
总被引数(次)
42592
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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