甘肃省猪香港病毒的巢式PCR检测及VP1基因序列的系统发育分析

• 作者: 曾巧英 潘阳阳 许芳 黄晓锋
• 来源期刊: 畜牧兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪香港病毒 巢式PCR 基因序列 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2015,（10）
• 所属期刊栏目: 预防兽医
• 页码范围: 1816-1821
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.2
• 字数: 3752字
• 语种: 中文
• DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.10.014

摘要

猪香港病毒(PHoV)于2008年在我国香港首次发现,属细小病毒新成员.本研究自甘肃省兰州、张掖、天水市养猪场和屠宰场采集血液样品147份,针对PHoV的VP1基因保守区(GenBank No.EU200677)设计2对引物,用巢式PCR(nPCR)检测PHoV.结果,甘肃省生猪PHoV总阳性率为38.10％(56/147).其中,12周龄以上猪的阳性率(55.56％)显著高于6周龄以下猪(25.00％)(P＜0.05);三地区间的阳性率差异不显著(P＞0.05).从56份阳性样本中挑选具地域代表性的12份,对VP1扩增片段测序(GenBank注册号:JQ177084～JQ177095),并和GenBank中的所有VP1序列一起进行系统发育分析.结果表明,12个VP1片段序列之间的相似性为95.2％～99.0％.其中,JQ177093、JQ177085和JQ177089构成一个独立的分支;其余9株和来自GenBank的12株参考序列均处于另一分支.9株中,JQ177095、JQ177087和JQ177091构成一个亚分支,紧邻罗马尼亚野猪株(JF738366);JQ177086、JQ177090和JQ177094构成第二个亚分支,紧邻香港株HK3;JQ177088、JQ177092和JQ177084构成第三个亚分支,紧邻香港株HK5.12株PHoV的VP1基因片段序列与香港株HK1～HK6的总体相似性为96.7％～99.7％,与罗马尼亚野猪株为95.2％～99.0％.本研究结果表明,源于罗马尼亚野猪株和香港株的PHoV均在甘肃省猪群中高水平流行.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	曾巧英	甘肃农业大学动物医学院	33	326	6.0	18.0
2	潘阳阳	甘肃农业大学动物医学院	40	69	5.0	7.0
3	黄晓锋	甘肃农业大学动物医学院	1	1	1.0	1.0
4	许芳	甘肃农业大学动物医学院	2	5	1.0	2.0