O型口蹄疫病毒VP1基因区序列系统发育树分型

• 作者: 徐福洲 梁之昶 相磊 石岗 章振华 胡国良 陈小玲
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: O型口蹄疫病毒 基因型/拓扑型 系统发育树 VP1基因
• 年，卷（期）: 2007,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 8-13
• 页数: 6页
• 分类号: S852.659.6|Q754
• 字数: 2780字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2007.03.003

摘要

从GenBank和世界口蹄疫参考实验室基因库(WRLFMD)下载O型FMDV全VP1序列共210条,其中23条为已知基因型序列,其他为未知基因型序列.利用分子生物学软件DNA Star中的ClustalW和TreeView工具,以已知基因型的VP1区序列构建系统发育树,验证分型结果与已知基因型是否一致.然后以已知基因型序列作为参照,将未知基因型序列与已知基因型序列一起构建系统发育树,以已知基因型序列在系统发育树中所处的位置,来判断未知基因型序列的归属,从而明确它们归属于何种基因型.结果表明,采用此种分型方法获得Cathay型74条、SEA型24条、EA型4条、WA型4条、Euro-SA型21条、ME-SA型68条、ISA-1型3条、ISA-2型2条,未能分型序列10条.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	梁之昶	新疆农业大学动物科技学院	4	5	1.0	2.0
2	石岗	北京市农林科学院畜牧兽医研究所	12	175	6.0	12.0
3	胡国良	江西农业大学动物科技学院	98	505	13.0	18.0
4	章振华	北京市农林科学院畜牧兽医研究所	50	172	6.0	10.0
5	陈小玲	北京市农林科学院畜牧兽医研究所	43	441	11.0	19.0
6	相磊	江西农业大学动物科技学院	4	14	2.0	3.0
8	徐福洲	北京市农林科学院畜牧兽医研究所	27	211	9.0	13.0