云南新分离四株流行性乙型脑炎病毒全基因组序列特征研究

• 作者: 冯云 孙玉杰 张海林 杨卫红 章域震
• 来源期刊: 疾病监测
• 学科: 医学
• 关键词: 流行性乙型脑炎病毒 全基因组 同源性分析 系统进化分析
• 年，卷（期）: 2015,（8）
• 所属期刊栏目: 传染病监测
• 页码范围: 618-623
• 分类号: R512.32
• 语种: 中文
• DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2015.08.004

摘要

目的 对云南省2009年和2010年分离的4株流行性乙型脑炎(乙脑)病毒进行全基因组序列测定和分析,阐明近期乙脑病毒流行株的分子生物学特征及基因型.方法 通过反转录-聚合酶链反应和核苷酸序列测定方法获得病毒全基因组序列,采用Clustal X、DNAstar和Mega等生物学软件进行核苷酸和推导氨基酸序列分析及系统进化分析.结果 2009年和2010年在云南省中部和西部地区三带喙库蚊(Culex tritaeriorhynchus)中分离到4株乙脑病毒,其中YN09M57株基因组全长10 967 bp,DH10M865、DH10M978和DHL10M62株基因组全长均为10 965 bp,均编码3432个氨基酸.这4株病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为98.3％ ～99.9％和99.5％ ～99.9％,与来自GenBank的7株基因Ⅰ型乙脑病毒核苷酸和氨基酸同源性分别为98.3％ ～99.9％和99.7％ ～99.9％;与基因Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ型参考株核苷酸和氨基酸同源性分别在78.7％～89.7％和91.4％ ～ 98.4％;与乙脑减毒活疫苗SA14-14-2株在E蛋白编码区有15个氨基酸位点差异,均位于抗原关键位点之外.基于E基因、全基因组系统进化分析显示云南4株乙脑病毒均为基因Ⅰ型,并形成2个进化分支,分别与相邻省份和东南亚流行株进化关系较近.结论 云南新分离4株乙脑病毒属基因Ⅰ型,虽然它们之间及其与该型参考株核苷酸和氨基酸位点存在某些差异,但决定病毒毒力和抗原性的关键位点未见明显变化.本研究提示这些乙脑病毒流行株具有稳定的遗传特性和地域特征.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张海林		59	408	13.0	18.0