1株麻雀源坦布苏病毒的分离鉴定及全基因组序列分析

• 作者: 刁有祥 刘鑫 孙晓艳 王蛟 葛平萍 郝东敏 陈浩
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 坦布苏病毒 分离鉴定 全基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 预防兽医学
• 页码范围: 201-206
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文

摘要

从山东地区某发病鸭场周围的麻雀体内分离到1株坦布苏病毒,命名为SDS株,并对分离毒株进行毒力测定.应用RT-PCR技术对分离株全基因组进行扩增并测序,将获得的SDS株坦布苏病毒全基因组序列与已在GenBank发表的24株坦布苏病毒和6株其他黄病毒属病毒全基因组序列进行遗传进化分析.结果表明,该株坦布苏病毒的基因组全长为10 990 nt,包含94 nt的5'端非编码区、618 nt的3 '端非编码区和一个开放阅读框(3 425个氨基酸),编码11种病毒蛋白;与GenBank已发表的坦布苏病毒的核苷酸序列同源性为98.2％～99.5％％,氨基酸序列同源性为98.1％～99.4％,其中与鸭源WFZ株(KC990545.1)的核苷酸序列同源性最高为99.5％,与鹅源坦布苏病毒(duck egg-drop syndrome virus strain goose,JQ920424.1)和鸡源坦布苏病毒(CJD50,JF926699)的核苷酸序列同源性较低为98.9％.用NetNGlyc 1.0 Server在线软件对病毒蛋白潜在糖基化位点进行预测,结果表明在SDS株病毒多聚蛋白中共有13个潜在的糖基化位点,分别位于5个不同病毒蛋白中.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刁有祥	山东农业大学动物科技学院	182	1328	18.0	28.0
2	陈浩	山东农业大学动物科技学院	18	113	7.0	10.0
3	刘鑫	山东农业大学动物科技学院	24	121	5.0	10.0
4	王蛟	山东农业大学动物科技学院	8	71	4.0	8.0
5	孙晓艳	山东农业大学动物科技学院	9	53	4.0	7.0
6	郝东敏	山东农业大学动物科技学院	2	23	2.0	2.0
7	葛平萍	山东农业大学动物科技学院	6	52	4.0	6.0