贝氏隐孢子虫Rhomboid基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 杜爱芳 薛雪 阳毅敏 陈学秋
• 来源期刊: 中国兽医学报
• 学科: 农学
• 关键词: 贝氏隐孢子虫 Rhomboid基因 染色体步移 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（2）
• 所属期刊栏目: 人兽共患病
• 页码范围: 235-241
• 分类号: S852.72|R535
• 语种: 中文

摘要

将GenBank中发表的C.parvum、C.hominis和C.muris的菱形体蛋白(Rhomboid,ROM)基因序列进行比对分析,设计合成该基因保守片段的1对特异性引物,以贝氏隐孢子虫基因组DNA为模板,PCR扩增出CbROM基因保守片段,采用染色体步移技术获得基因片段3'端和5 '端核苷酸序列,并对所得序列进行测序、拼接与生物信息学分析.结果显示,CbROM基因ORF长度为l 422 bp,编码473个氨基酸,蛋白质理论相对分子质量为52 700,等电点为8.65,是疏水性蛋白质,含有7个串连的跨膜螺旋区,无信号肽;该基因含有典型的菱形体蛋白相关保守结构域,属于菱形体蛋白酶家族;功能位点分析结果显示,CbROM蛋白序列包含6个N糖基化位点,2个cAMP、cGMP依赖性蛋白激酶磷酸化位点,8个蛋白激酶C磷酸化位点,7个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和10个N-豆蔻酰化位点;二级结构中包含α螺旋38.27％,β-折叠16.7％和无规则卷曲45.03％.本试验获得的贝氏隐孢子虫的Rhomboid基因序列,为该基因功能的进一步研究及其基因工程疫苗的研制奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜爱芳	浙江大学动物科学学院	78	635	14.0	22.0
2	阳毅敏	浙江大学动物科学学院	2	1	1.0	1.0
3	陈学秋	浙江大学动物科学学院	10	10	2.0	2.0
4	薛雪	浙江大学动物科学学院	1	0	0.0	0.0