猪丹毒杆菌SpaA基因的生物信息学分析

• 作者: 卢琴 宋忠旭 彭先文 李明波 梅书棋 雷彬
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪丹毒 PCR检测 SpaA 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2015,（9）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 23-27
• 页数: 5页
• 分类号: S852.61
• 字数: 2553字
• 语种: 中文

摘要

旨在对猪丹毒杆菌的SpaA基因进行PCR检测,并对该基因所编码的氨基酸序列进行生物信息学分析.首先对猪丹毒杆菌SpaA基因进行PCR检测,后将SpaA基因的保守区域进行生物信息学分析.结果表明,PCR扩增得到了与猪丹毒杆菌SpaA基因大小一致的1 531 bp片段,二级结构的预测结果显示,该蛋白主要以螺旋、无规则卷曲为主,只有少数的伸展链.推测该蛋白有4个B细胞抗原表位区域.该研究为猪场猪丹毒杆菌病的检测提供了试验数据,也为阐明猪丹毒杆菌病的免疫机理和制备表位疫苗等奠定理论基础.