弧菌基因组中整合性接合元件(ICEs)的预测分析

• 作者: 陈兰明 龚丽
• 来源期刊: 广东农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 弧菌 整合性接合元件 全基因组
• 年，卷（期）: 2015,（16）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 96-102
• 页数: 7页
• 分类号: Q931
• 字数: 5381字
• 语种: 中文

摘要

整合性接合元件(ICEs)是一种广泛存在于细菌中可以自主移动的遗传元件.ICEs通过水平移动整合到弧菌的染色体上,所携带的新基因有助于宿主在特定生存环境下获得生长优势.为考察ICEs在弧菌生长中发挥的作用,采用PrfC位点与核心基因相关的特征蛋白,进行J了26株弧菌SXT/R391 ICEs的预测.结果表明,在全测序的26株弧菌中,只有3株霍乱弧菌的较大染色体上存在SXT/R391 ICEs,对这3株霍乱弧菌上SXT/R391 ICEs的抗性基因和热点区域进行比较分析,结果表明,3株霍乱弧菌的SXT/R391ICE的抗性基因和热点区域虽然都拥有类似的骨架结构,但从获取基因的得失情况可以判断,这3株菌SXT/R391 ICE的进化优先关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈兰明	上海海洋大学食品科学与技术学院	8	58	3.0	7.0
2	龚丽	上海海洋大学食品科学与技术学院	1	0	0.0	0.0