响应面法优化海洋沉积物微生物总DNA提取方法

• 作者: 于翠芳 张名爱 程凡升 赵新强 郭瑞
• 来源期刊: 青岛农业大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 响应面法 海洋沉积物微生物 DNA提取
• 年，卷（期）: 2016,（3）
• 所属期刊栏目: 食品科学与工程
• 页码范围: 197-202,213
• 页数: 7页
• 分类号: Q812
• 字数: 4614字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/J.ISSN.1674-148X.2016.03.009

摘要

海洋沉积物中的微生物是自然界生态系统中不可或缺的组分,在维持环境与海洋生态平衡方面发挥着重要作用.在海洋沉积物微生物的研究中,细胞裂解率低、片段不够完整等问题导致无法高效地提取微生物的总DNA片段.本实验采用响应面分析法对CTAB-SDS-冻融DNA提取法进行优化.根据单因素的实验结果,选取溶菌酶含量、65℃水浴时间、蛋白酶K含量作为影响因子,利用Box-Behnken进行实验设计,将DNA浓度作为响应值,进行DNA提取方法的响应面优化实验.结果发现:当溶菌酶含量为1.13 mg/mL、65℃水浴时间为100 min、蛋白酶K含量为0.21 mg/mL时,DNA提取效果达到最好.验证实验表明:优化后提取DNA的实际值与理论值相近,具有可行性,优化后提取的DNA片段在纯度、浓度方面高于优化之前.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张名爱	青岛农业大学食品科学与工程学院	87	602	13.0	17.0
2	于翠芳	青岛农业大学食品科学与工程学院	21	84	7.0	8.0
3	郭瑞	青岛农业大学食品科学与工程学院	8	16	3.0	3.0
4	程凡升	青岛农业大学食品科学与工程学院	24	63	5.0	7.0
5	赵新强	青岛农业大学食品科学与工程学院	3	5	1.0	2.0