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摘要:
以地黄为材料,通过分析地黄转录组数据,设计特异性引物,克隆了地黄牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶(geranylgeranyl pyrophosphate synthase,GGPPS)基因的cDNA序列,命名为RgGGPPS1,GenBank登录号为KU258808.同时在生物信息学分析的基础上,进行原核表达、纯化以及组织特异性表达分析.结果显示:(1)RgGGPPS1基因开放阅读框为987 bp,编码328个氨基酸.(2)生物信息学分析结果显示,RgGGPPS1蛋白含有2个富含天冬氨酸的基序(DDXXXXDD和DDXXD),与芝麻等双子叶植物中的GGPPS蛋白相似性较高.(3)利用构建的原核表达载体pET-32a-RgGGPPS1在大肠杆菌BL21(DE3)菌株中成功表达RgGGPPS1重组蛋白,采用Ni2+亲和层析得到了纯化的RgGGPPS1重组蛋白.(4)荧光定量PCR结果显示,RgGGPPS1基因在根中表达量最高,叶、茎中表达量较低.研究结果为进一步研究RgGGPPS1基因在地黄环烯醚萜苷生物合成途径中的功能奠定了基础.
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文献信息
篇名 地黄GGPPS1基因克隆及表达分析
来源期刊 西北植物学报 学科 生物学
关键词 地黄 RgGGPPS1基因 生物信息学分析 原核表达 表达分析
年,卷(期) 2016,(5) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 888-895
页数 8页 分类号 Q785|Q786
字数 5795字 语种 中文
DOI 10.7606/j.issn.1000-4025.2016.05.0888
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研究主题发展历程
节点文献
地黄
RgGGPPS1基因
生物信息学分析
原核表达
表达分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
西北植物学报
月刊
1000-4025
61-1091/Q
大16开
陕西省杨陵邰城路3号西北农林科技大学
52-73
1980
chi
出版文献量(篇)
7739
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9
总被引数(次)
145271
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