美洲鲎miRNA的生物信息学挖掘与分析

• 作者: 朱珊珊 翁朝红 肖世俊 谢仰杰 韩兆方
• 来源期刊: 集美大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: miRNA 美洲鲎 生物信息学 挖掘
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 水产、食品与生物技术
• 页码范围: 107-114
• 页数: 8页
• 分类号: Q74
• 字数: 4842字
• 语种: 中文

摘要

利用miRBase数据库中已有动物的小RNA (miRNA),通过生物信息学方法对美洲鲎(Limulus polyphemus)表达序列标签(Expressed Sequences Tag,EST)和cDNA进行序列比对,挖掘美洲鲎miRNA,得到了72个miRNA前体(pre-miRNA)、49个可编码成熟miRNA,隶属于40个miRNA家族.miRNA家族归类结果表明,无论在低等脊椎动物还是高等动物中,miRNA家族的存在都是相当保守的.以miR-10基因前体为例,分析其序列与其他物种同源序列的差异,显示miRNA序列的高度保守性.miR-10前体序列分析系统进化发现,物种聚类与传统分类亲缘关系一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	翁朝红	集美大学水产学院	18	148	6.0	12.0
3	肖世俊	集美大学水产学院	5	94	3.0	5.0
7	韩兆方	集美大学水产学院	2	2	1.0	1.0
11	朱珊珊	集美大学水产学院	1	1	1.0	1.0