玉米PDE191基因全长cDNA的克隆及其生物信息学分析

• 作者: 刘久东 孙美涛 张海洋 杨飞 熊伟
• 来源期刊: 井冈山大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 玉米 PDE191基因 全长cDNA 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 生命科学
• 页码范围: 36-42,57
• 页数: 8页
• 分类号: Q781|Q811.4
• 字数: 5555字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-8085.2016.05.008

摘要

为研究玉米白化相关基因PDE191序列信息和基因功能,以玉米叶片总RNA逆转录后的cDNA为模板,采用RT-PCR和RACE技术克隆出玉米PDE191基因全长cDNA.DNA测序及生物信息学分析表明,玉米PDE191基因cDNA全长1229 bp, 编码333个氨基酸的蛋白质,亚细胞定位于线粒体和叶绿体.软件预测PDE191蛋白分子量为37.79kD,理论等电点为9.12,该蛋白二级结构主要构成元件为α螺旋和无规则卷曲,包含7个MTERF结构域.三级结构预测显示该蛋白为球状结构,预测结果与二级结构预测的结果相符.对该蛋白进行多重序列比对和聚类分析显示,PDE191属于植物MTERF家族,在不同植物中存在其同源蛋白质,其中与拟南芥PDE191氨基酸序列的相似性高达99％.本研究为进一步研究玉米PDE191基因的功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	熊伟	大理大学基础医学院	14	63	5.0	7.0
3	杨飞	云南农业大学高原特色农业产业研究院	7	32	2.0	5.0
6	孙美涛	大理大学基础医学院	27	57	4.0	6.0
7	张海洋	大理大学基础医学院	8	38	3.0	6.0