利用高通量测序技术快速解析草莓病毒基因组序列

• 作者: 代红艳 张志宏 李伟佳 郑文燕 郭巍
• 来源期刊: 沈阳农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 草莓 转录组测序 病毒 基因组
• 年，卷（期）: 2016,（5）
• 所属期刊栏目: 姻研究报告
• 页码范围: 536-540
• 页数: 5页
• 分类号: S668.4
• 字数: 3326字
• 语种: 中文

摘要

高通量测序技术是近年来发展起来的一种重要的分子生物学技术，能一次对几十万至几百万条DNA分子进行序列测定，在基因组解析、转录组分析、基因变异位点筛查等方面广泛应用。探讨通过对感染病毒的草莓材料进行转录组测序来解析病毒基因组的可行性。以怀疑感染病毒的草莓叶片为试材，利用Illumina测序技术进行转录组测序分析。通过对组装得到的单基因序列进行注释分析，筛选出12个注释为草莓病毒的单基因序列，它们源自4种草莓病毒，分别是草莓轻型黄边病毒、草莓坏死休克病毒、草莓镶脉病毒及草莓皱缩病毒。利用RT-PCR技术对转录组测序结果进行了验证，表明利用高通量测序技术解析草莓病毒基因组序列的可靠性。本研究探索出解析草莓病毒基因组序列信息的新方法，为研究草莓病毒的进化和病毒分子检测奠定基础。