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摘要:
Jacalin凝集素(jacalin-related lectins,JRLs)是一类含有一个或多个JRL结构域的蛋白质,参与生物或非生物环境刺激应答.本研究基于金针菇(Flammulina velutipes)基因组数据,注释筛选到其中一个JRL基因Fv-mJRL1,对其基因结构、蛋白质性质进行了生物信息学分析,并利用其上游调控序列进一步预测到该基因潜在的转录因子Fv-Mbp1.通过实时荧光定量PCR分析得知,无论是在不同栽培基质培养的金针菇菌丝还是在金针菇各发育时期的组织中,Fv-mJRL1基因与潜在的转录因子基因Fv-Mbp1之间都存在极强的共表达规律.生物信息学及实时荧光定量PCR分析为筛选挖掘基因潜在的转录因子提供便利,后期仍需利用下游分子实验进行更为精确的验证.
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文献信息
篇名 金针菇凝集素基因Fv-mJRL1的生物信息学分析及其共表达
来源期刊 厦门大学学报(自然科学版) 学科 生物学
关键词 jacalin凝集素 子实体形成 潜在转录因子 皮尔森相关系数
年,卷(期) 2016,(3) 所属期刊栏目
研究方向 页码范围 323-329
页数 7页 分类号 Q933
字数 5473字 语种 中文
DOI 10.6043/j.issn.0438-0479.2016.03.004
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 谢宝贵 福建农林大学生命科学学院菌物研究中心 186 1536 20.0 28.0
2 王威 福建农林大学生命科学学院菌物研究中心 51 204 8.0 11.0
3 严俊杰 福建农林大学生命科学学院菌物研究中心 22 57 4.0 6.0
4 陈仁良 福建农林大学生命科学学院菌物研究中心 4 13 3.0 3.0
5 熊宏民 福建农林大学生命科学学院菌物研究中心 1 4 1.0 1.0
传播情况
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引文网络
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研究主题发展历程
节点文献
jacalin凝集素
子实体形成
潜在转录因子
皮尔森相关系数
研究起点
研究来源
研究分支
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相关学者/机构
期刊影响力
厦门大学学报(自然科学版)
双月刊
0438-0479
35-1070/N
大16开
福建省厦门市厦门大学囊萤楼218-221室
34-8
1931
chi
出版文献量(篇)
4740
总下载数(次)
7
总被引数(次)
51714
相关基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)
英文译名:National Basic Research Program of China
官方网址:http://www.973.gov.cn/
项目类型:
学科类型:农业
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