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不同品种桂花转录组分析及桂花精油成分差异的初步探讨
不同品种桂花转录组分析及桂花精油成分差异的初步探讨
作者:
张雪松
房仙颖
汤锋
裴建军
解静聪
赵林果
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
桂花
精油合成
转录组分析
RNA-seq
摘要:
为丰富桂花转录组数据信息,阐明不同品种桂花精油合成的分子差异,本研究选择三种不同品种桂花,通过Illumina Hiseq2000平台测序,总计产出14.4G数据,三个品种的桂花样品共获得70029个Unigene序列,平均长度762 nt,N50达到1183 nt.通过Unigene的表达差异分析与通路富集分析,发现与桂花精油物质合成途径有关的差异基因主要注释在二萜合成、萜类骨干化合物合成、单萜合成、倍半萜与三萜合成、苯丙烷类合成、苯丙酸类代谢、亚麻酸代谢以及亚油酸代谢8个通路中.而三种桂花差异基因均显著富集的通路则注释在苯丙烷类合成、苯丙酸类代谢、二萜合成以及萜类骨干化合物合成通路,共获得650个编码精油物质合成途径中54个差异酶的差异基因.本研究建立了以金球桂、白洁和日香桂为代表的桂花转录组数据库.通过转录组分析,确定了不同品种桂花精油物质合成差异的表达途径,初步分析了转录组数据库中与精油物质合成途径相关的差异基因.本研究将为桂花精油成分代谢调控及体外表达提供依据.
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文献信息
篇名
不同品种桂花转录组分析及桂花精油成分差异的初步探讨
来源期刊
天然产物研究与开发
学科
生物学
关键词
桂花
精油合成
转录组分析
RNA-seq
年,卷(期)
2016,(4)
所属期刊栏目
研究简报
研究方向
页码范围
529-535
页数
7页
分类号
Q759
字数
语种
中文
DOI
10.16333/j.1001-6880.2016.4.011
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桂花
精油合成
转录组分析
RNA-seq
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
天然产物研究与开发
主办单位:
中国科学院成都文献情报中心
出版周期:
月刊
ISSN:
1001-6880
CN:
51-1335/Q
开本:
大16开
出版地:
四川省成都市一环路南二段16号
邮发代号:
62-107
创刊时间:
1989
语种:
chi
出版文献量(篇)
5862
总下载数(次)
12
总被引数(次)
60408
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