普通烟草ARF基因家族序列的鉴定与表达分析

• 作者: 孙亭亭 孙玉合 张磊 王大伟 陈乐 陈蕾 陈雅琼 龚达平
• 来源期刊: 植物遗传资源学报
• 关键词: 普通烟草 ARF基因家族 系统进化 基因表达
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 基因挖掘
• 页码范围: 162-168
• 语种: 中文
• DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.2016.01.024

摘要

ARF(AUXIN RESPONSE FACTOR)基因含有一个B3功能域和具有转录激活或抑制活性的中心功能域,在植物发育过程中起到非常重要的作用.本研究采用生物信息学方法,根据拟南芥ARF基因序列鉴定了普通烟草基因组中的ARF基因,并对家族成员进行了序列特征、系统发生、亚细胞定位和表达模式分析.目前在普通烟草基因组中共得到50个ARF基因成员,其基因结构相对复杂,一般含有10个外显子.亚细胞定位结果表明,少数ARF蛋白定位到线粒体或叶绿体,大多数未检测到定位信号.转录组数据分析表明,ARF基因具有不同的组织表达模式,部分基因表现出组织特异性.这些研究结果为普通烟草ARF基因家族功能的深入研究奠定了基础.