生防蜡样芽胞杆菌Bacillus cereus 905基因组测序及分析

• 作者: 丁海霞 李燕 牛犇 王琦 范海燕
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 植物促生细菌 蜡样芽胞杆菌 生物防治 基因组测序 分子机制
• 年，卷（期）: 2016,（12）
• 页码范围: 49-57
• 分类号: S476|S432
• 语种: 中文
• DOI: 10.11841/j.issn.1007-4333.2016.12.07

摘要

为深入研究蜡样芽胞杆菌905 (Bacillus cereus 905)的促生防病机制以及为进一步优化该菌株提供遗传学信息,采用454焦磷酸测序技术对B.cereus 905基因组进行了测序,并使用相关软件对测序数据进行了基因组拼接、基因功能预测与注释、基因本体分析(GO)、直系同源基因簇(COG)聚类分析以及共线性分析.结果表明:B.cereus 905基因组草图序列大小约为5.39 Mb,GC含量35.05％,由127个片段重叠群组成;该序列已提交GenBank数据库,登录号为LSTW00000000;分析发现菌株905的基因组与其他蜡样芽胞杆菌的基因组有显著的共线性关系;菌株905基因组中存在相当数量的与促生防病功能相关的基因.本研究通过对B.cereus 905基因组的测序为该菌株的优化提供了序列信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王琦	中国农业大学植物保护学院	74	972	16.0	29.0
2	李燕	中国农业大学植物保护学院	41	306	10.0	16.0
3	范海燕	中国农业大学植物保护学院	2	2	1.0	1.0
4	丁海霞	中国农业大学植物保护学院	5	52	4.0	5.0