基于序列信息预测内含子保留型可变剪接

• 作者: 李敏 李瑞彬 蔡禄 邢永强
• 来源期刊: 湖北农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 可变剪接 内含子保留 多样性增量 二次判别函数
• 年，卷（期）: 2016,（1）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 208-213
• 页数: 6页
• 分类号: Q61
• 字数: 4215字
• 语种: 中文
• DOI: 10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2016.01.055

摘要

可变剪接是遗传信息传递与表达的重要环节,真核生物多外显子基因pre-mRNA的可变剪接现象非常普遍.可变剪接增加了蛋白质的多样性,影响诸如细胞组织特异性分化、个体发育、疾病发生等重要的生物学过程.基于内含子的k-mer(k=1…5)信息,利用多样性增量结合二次判别的方法,对保留型内含子和组成型内含子进行了区分.五折交叉检验显示的预测总精度、敏感性和特异性均大于70％.表明内含子的序列信息可能对保留型内含子的剪接有重要调控作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	蔡禄	内蒙古科技大学数理与生物工程学院	128	509	11.0	16.0
2	邢永强	内蒙古科技大学数理与生物工程学院	15	17	2.0	3.0
3	李敏	内蒙古科技大学数理与生物工程学院	12	14	2.0	3.0
4	李瑞彬	内蒙古科技大学数理与生物工程学院	1	2	1.0	1.0