基于SVM的革兰氏阴性菌分泌系统蛋白识别方法

• 作者: 余乐正 柳凤娟 罗杰斯 赵柳青 陈曼
• 来源期刊: 四川大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 革兰氏阴性细菌 分泌系统蛋白 SVM 位置特异性得分矩阵
• 年，卷（期）: 2016,（2）
• 所属期刊栏目: 生物学
• 页码范围: 443-447
• 页数: 5页
• 分类号: Q811.4
• 字数: 4069字
• 语种: 中文
• DOI: 103969/j.issn.0490-6756.2016.03.032

摘要

本文提出了一种基于SVM快速识别革兰氏阴性菌分泌系统蛋白的方法.该方法以氨基酸组成和位置特异性得分矩阵为最优特征集,充分考虑了蛋白质的序列信息及进化信息.实验结果表明,本文提出的方法对革兰氏阴性菌分泌系统蛋白具有较好的预测性能,可作为细菌分泌系统研究的有益补充.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	柳凤娟	贵州师范学院化学与生命科学学院	13	32	4.0	4.0
2	余乐正	贵州师范学院化学与生命科学学院	12	32	4.0	4.0
6	罗杰斯	四川大学化学学院	3	7	2.0	2.0
7	陈曼	贵州师范学院化学与生命科学学院	2	5	2.0	2.0
8	赵柳青	贵州师范学院化学与生命科学学院	2	5	2.0	2.0