豆科植物查尔酮合成酶基因密码子偏好性分析

• 作者: 周嘉裕 尹哲宁 廖海 张家琪 徐悦 李思远 李晓冰
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 豆科植物 查尔酮合成酶 密码子偏好性 聚类分析
• 年，卷（期）: 2016,（6）
• 页码范围: 12-20
• 页数: 9页
• 分类号: Q78
• 字数: 4564字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7668/hbnxb.2016.06.003

摘要

查尔酮合成酶(Chalcone synthase,CHS)是参与合成植物苯丙烷类物质的主要酶类之一.研究豆科植物CHS基因密码子的偏好性,对提高豆科植物CHS基因的表达水平具有重要意义.为此,运用CHIPS、CUSP和CodonW程序分析豆科植物CHS基因密码子的偏好性,并用决明CHS基因对分析结果的可信度进行验证.结果表明,在豆科植物CHS基因的密码子中,以A或U结尾的密码子偏好性较强.基于CHS基因RSCU值的聚类结果显示,豆科植物与茄科植物(包括烟草)聚为一类,表明烟草作为研究豆科植物CHS基因功能的模式植物较为合适.通过对决明CHS基因密码子偏好性与大肠杆菌和酵母基因组密码子偏好性的比较,发现两者均存在差异,但酵母的差异低于大肠杆菌,表明酵母表达系统更加适合作为决明CHS基因的外源表达系统.然而,若要使决明CHS基因能够在酵母表达系统中高效表达,仍需对其密码子进行优化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	廖海	西南交通大学生命科学与工程学院	56	197	9.0	11.0
2	周嘉裕	西南交通大学生命科学与工程学院	54	196	9.0	11.0
3	张家琪	西南交通大学生命科学与工程学院	1	2	1.0	1.0
4	徐悦	西南交通大学生命科学与工程学院	1	2	1.0	1.0
5	李晓冰	西南交通大学生命科学与工程学院	4	27	2.0	4.0
6	李思远	西南交通大学生命科学与工程学院	2	2	1.0	1.0
7	尹哲宁	西南交通大学生命科学与工程学院	1	2	1.0	1.0