牙鲆精氨酸酶基因片段的克隆及序列分析

• 作者: 刘华 施婷婷 施志仪
• 来源期刊: 广东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 牙鲆 精氨酸酶 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2016,（12）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医·水产养殖
• 页码范围: 108-114
• 页数: 7页
• 分类号: S917
• 字数: 4312字
• 语种: 中文
• DOI: 10.16768/j.issn.1004-874X.2016.12.019

摘要

根据GenBank中虹鳟、大菱鲆、斑马鱼及其他生物的精氨酸酶基因序列设计并合成一对引物,并提取变态期牙鲆仔鱼总RNA作为模板进行RT-PCR,得到一条eDNA片段.将产物连接到T载体中,转化、扩增重组质粒.提取大肠杆菌中的重组质粒进行DNA测序.将DNA测序所得到的基因序列翻译成蛋白序列和已知的大菱鲆、鲤鱼、虹鳟、斑马鱼的精氨酸酶基因序列进行同源性分析.结果显示,利用RT-PCR的方法扩增出一条284 bp的目的基因片段,比对结果发现,其与大菱鲆、鲤鱼、斑马鱼以及虹鳟精氨酸酶基因蛋白序列的同源性分别为96％、85％、84％和82％.对蛋白序列进行生物信息学分析发现,整个蛋白序列中无信号肽,无糖基化位点,无跨膜结构域,但含有一个典型的arginase结构.在N-端第38～44、57 ～ 64、71～ 76、89～ 94区段有β-折叠中心;第7～18、50 ～ 52、81～87区段可能形成α螺旋区域.Arg蛋白N端第37～ 45和第74～ 77区段为优势抗原表位区域.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	施志仪	上海海洋大学生物技术研究中心	48	217	9.0	11.0
2	刘华	南宁富莱欣生物科技有限公司研发中心	7	3	1.0	1.0
3	施婷婷	南宁富莱欣生物科技有限公司研发中心	2	1	1.0	1.0