不同物种LH-β基因的生物信息学分析

• 作者: 周荣艳 李兰会 李相运 李祥龙 锡建中 陈辉 魏彦辉
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: LH-β基因 生物信息学 蛋白特性 繁殖性状
• 年，卷（期）: 2016,（9）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 21-26
• 页数: 6页
• 分类号: S813.1
• 字数: 4298字
• 语种: 中文

摘要

为了研究不同物种LH-β基因的遗传多样性,采用生物信息学方法对LH-β基因进行了分析.从NCBI中选择了15个物种共73条LH-β基因编码区序歹,并对该基因的遗传多样性、氨基酸序列、信号肽、跨膜结构域、亲水性/疏水性、蛋白质二级和三级结构进行了预测和分析.结果表明:在15个物种的73条基因序列中共检测到687个多态位点,生成55个单倍型;突变位点总数为23到146个;物种间的核苷酸歧异度(Dxy)在0.030到0.275之间,遗传分化(Gst)在0.000到0.183之间,净遗传距离(Da)在0.007到0.264之间.LH-β编码的蛋白呈碱性,N端有信号肽,没有跨膜结构域,肽链表现为亲水性.蛋白质二级结构主要结构元件是α-螺旋、延伸链和不规则卷曲.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈辉	河北农业大学动物科技学院	149	765	14.0	21.0
2	锡建中	河北农业大学动物科技学院	44	93	5.0	7.0
3	李兰会	河北农业大学动物科技学院	120	583	13.0	17.0
4	李相运	河北农业大学动物科技学院	29	85	5.0	7.0
5	周荣艳	河北农业大学动物科技学院	105	307	9.0	11.0
6	魏彦辉	河北农业大学动物科技学院	11	23	3.0	4.0