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苹果磷酸烯醇式丙酮酸羧化激酶基因(PEPCKs)的克隆与表达分析
苹果磷酸烯醇式丙酮酸羧化激酶基因(PEPCKs)的克隆与表达分析
作者:
何平
冉昆
常源升
李慧峰
李林光
王海波
程来亮
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
苹果
磷酸烯醇式丙酮酸羧化激酶
序列分析
胁迫诱导
表达分析
摘要:
【目的】克隆苹果(Malus×domestica Borkh.)多个代谢途径中的关键酶磷酸烯醇式丙酮酸羧化激酶(phosphoenolpyruvate carboxykinase,PEPCK)基因MdPCKs,研究其在不同组织器官及不同胁迫处理条件下的表达特性,为解析该基因在多个代谢途径中的功能奠定基础。【方法】利用同源比对和RT-PCR技术,克隆获得MdPCK1和MdPCK2全长cDNA序列并进行生物信息学分析;克隆MdPCKs的启动子序列,利用PlantCARE软件在线分析启动子上的顺式作用元件;采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测MdPCKs在不同组织中的表达以及在水杨酸(SA)、茉莉酸(JA)、脱落酸(ABA)、模拟干旱(PEG)、高温(40℃)和低温(8℃)处理条件下的表达特性。【结果】获得2个苹果磷酸烯醇式丙酮酸羧化激酶基因(MdPCK1和MdPCK2;GenBank登录号分别为KT454964和KT454965),其开放阅读框(open reading frame,ORF)分别为2001 bp和2028 bp,分别编码666和675个氨基酸残基;基因结构和进化分析表明,MdPCK1和MdPCK2均由12个外显子组成,且序列结构进化高度保守;氨基酸序列和结构分析显示,二者均含有保守的PEPCK ATP domain区域;启动子分析显示,MdPCK1和MdPCK2启动子区域含有多个顺式作用元件,包括光响应元件、昼夜节律相关顺式作用元件、JA响应元件、SA响应元件、ABA响应元件、防御及逆境响应元件、低温响应元件和热激响应元件等;qRT-PCR结果显示,MdPCKs在被检测的组织中均有表达。在‘泰山嘎啦’苹果果实不同发育阶段,MdPCK1和MdPCK2具有相似的表达模式。在多种非生物胁迫处理下,MdPCK1受到100μmol·L-1 ABA和100 g·L-1 PEG胁迫诱导;MdPCK2受到150μmol·L-1 SA、100μmol·L-1 ABA、100 g·L-1 PEG和低温胁迫诱导。【结论】MdPCK1和MdPCK2属于植物PEPCK家族,非生物逆境胁迫可诱导MdPCK1和MdPCK2表达。
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文献信息
篇名
苹果磷酸烯醇式丙酮酸羧化激酶基因(PEPCKs)的克隆与表达分析
来源期刊
中国农业科学
学科
关键词
苹果
磷酸烯醇式丙酮酸羧化激酶
序列分析
胁迫诱导
表达分析
年,卷(期)
2016,(7)
所属期刊栏目
研究简报
研究方向
页码范围
199-210
页数
12页
分类号
字数
7508字
语种
中文
DOI
10.3864/j.issn.0578-1752.2016.07.017
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
李林光
142
574
12.0
17.0
2
李慧峰
76
332
10.0
15.0
3
冉昆
49
116
5.0
9.0
4
王海波
61
234
8.0
12.0
5
何平
43
120
6.0
8.0
6
常源升
27
82
6.0
8.0
7
程来亮
15
73
6.0
7.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
二级参考文献
(127)
共引文献
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参考文献
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节点文献
引证文献
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同被引文献
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二级引证文献
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引证文献(1)
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引证文献(1)
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引证文献(1)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
苹果
磷酸烯醇式丙酮酸羧化激酶
序列分析
胁迫诱导
表达分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国农业科学
主办单位:
中国农业科学院
出版周期:
半月刊
ISSN:
0578-1752
CN:
11-1328/S
开本:
大16开
出版地:
北京中关村南大街12号
邮发代号:
2-138
创刊时间:
1960
语种:
chi
出版文献量(篇)
9193
总下载数(次)
12
总被引数(次)
254208
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