家兔MC4R和ASIP基因的多态性筛选及生物信息学分析

• 作者: 冯艳青 刘若余 李思 李维 杜雪琴 林家栋 肖超能 谢海强
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: MC4R基因 ASIP基因 新西兰兔 加利福尼亚兔 中国白兔 SNPs
• 年，卷（期）: 2016,（11）
• 所属期刊栏目: 兽医科技
• 页码范围: 77-82
• 页数: 6页
• 分类号: S892.1
• 字数: 4268字
• 语种: 中文

摘要

以比利时公兔分别与加利福尼亚母兔、新西兰母兔和中国白母兔杂交兔为试验对象,用磁珠法动物基因组抽提试剂盒(血液)提取DNA并构建三组杂交兔的DNA池,采用双向测序技术对兔MC4R和ASIP基因SNPs进行筛选,结果在MC4R基因中发现了5个多态性位点:exon1-T33G、exon1-C52T、exon1-A101G、exon1-C105T、exon1-A492G,在ASIP基因中发现了2个多态位点:exon2-A185G和intron2-G64A.其中exon1-T33G、exon1-C105T、exon1-A492G为同义突变,intron2-G64A在内含子上,exon1-C52T、exon1-A101G和exon2-A185G为错义突变,分别使编码氨基酸由精氨酸(Arg)变为苏氨酸(Thr),天冬氨酸(Asp)变为甘氨酸(Gly)和组氨酸(His)变为精氨酸(Arg).通过生物信息学对兔MC4R和ASIP基因突变前后RNA二级结构、蛋白质的二级结构和蛋白质的三级结构进行预测,其结果都有差异.